2020年12月16日 星期三

安裝 NEURON

 NEURON 是一種模擬電生理的程式。

https://neuron.yale.edu/neuron/

在 Ubuntu 下可以直接安裝

$ sudo apt install neuron

$ pip3 install neuron

啟動程式的方法

$ nrngui

安裝好後,可以測試一個 demo 的程式,第一次執行,必須 compile 一些程式,須用 sudo

$ sudo neurondemo

以後再執行時,可直接打

$ neurondemo

 

Note:

1. 啟動時會出現找不到字型的問題,出現以下訊息,但還是可以使用。

unable to open font "*helvetica-medium-r-normal*--14*", using "fixed"
解法:安裝以下字型,登出再登入後,即可使用。
$ sudo apt install xfonts-100dpi

 

2.  也可以使用 Python 環境執行 NEURON,再 Python 界面下,輸入

>> from neuron import h, gui

>> import neuron

可以執行以下函數測試

>> neuron.test()

若測試都成功,傳回 True,即表示安裝成功。


3. 再安裝 mpi,這是某些功能所需

$ sudo apt install libopenmpi-dev